往期我们介绍了蛋白质免疫印迹(Western Blot)相关实验结果分析知识点及实验操作。
往期回顾三:蛋白质免疫印迹(Western Blot,WB )实验操作
今天小编根据实验案例跟大家更加细致的讲解WB实验会出现的问题及解决方法。
1. 案例一
难点:内参一直跑不齐
解决过程:①根据灰度值计算进行多次内参调整;②重新制样;③更改上样量;④用指标膜再生内参 。依旧不齐。
原因分析:细胞样本不同,与抗体反应能力不同,因此内参会产生这种特殊情况,想要跑齐内参上样量将会差非常多,后续分析对应相应的内参即可。
总结反思:内参多次不齐后,思考是否是样本问题,找准原因,注意是否样本本身内参就无法跑齐,不要一味地浪费大量时间精力还有资源。
2. 案例二
难点:LC3B I/II(abcam ab48394)指标出现拥挤反白现象。
解决过程:经过重复实验,多次操作,讨论出现这种情况的几个原因:小分子指标(17,19KD)减少了电泳时间,电泳时间过短条带未跑开;样本有问题;电泳过程漏液。排除了这些问原因后问题依旧出现,增加了洗膜时间后曝光,这种现象消失。
总结反思:小分子指标曝光较难,曝光前可多洗洗,隔段时间曝光一次;注意控制电泳时间,防止小分子指标弥散。
3. 案例三
难点:小分子指标(11、13KDa),条带曝光不出来,或者效果不好。
解决过程:先后进行了减少电泳时间、更换0.22um的膜、增加洗膜时间等方法,效果依旧不理想,开始尝试配制18%浓度的胶,并进行冰水浴电泳防止小分子指标跑散。
总结反思:针对这么小的小分子指标,经验已经无法解决问题,需要我们进行尝试和摸索,根据具体案例具体调整分析,例如冰水浴电泳、更高浓度的胶。
问题1:配胶时,经常出现气泡或者絮状物杂质,还会出现脱胶问题
解决方法:
①采用保鲜膜包裹底座防止气泡产生;
②及时更换吸水纸;加琼脂少量快速,不要碰到梳子;
③不同的胶凝固时间根据温度条件灵活把控,比如15%或者18%的胶凝固快,可以缩短凝固时间到24min左右,或者减少TEMD的量;
④倒浓缩胶前晒干过程尽量不要倒扣,冰箱里保存时容器里放一些水。
问题2:曝光时,有时膜上杂质过多,小分子指标出现拥挤条反白条带
解决方法:
①目的条带充分跑开,小分子指标不要跑丢,小分子指标可适当缩短电泳时间,大分子量增加电泳时间;
②膜上较脏或者看不到目的条带的可增加曝光前TBST洗膜时间,尤其是小分子指标;
③封闭液摇匀,冰箱放置后使用上层液体,防止沉淀中杂志附着在膜上;
④磷酸化指标改用5%BSA封闭过夜。
问题3:电泳时漏样
解决方法:
①配胶要混均匀,玻璃板无杂质;
②加浓缩胶前放置时间久一点,确保无水乙醇充分挥发;
③提取蛋白时,离心后只吸上清,一定不要有沉淀,蛋白变性前再离心一次,以保证样本无干扰;
④组织样本上样前离心时间在半分钟以上,有效减少漏样问题。
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