RNA-Seq技术，全称为：RNA sequencing，是通过高通量测序手段，即二代测序技术（NGS），来检测某一特定时间点，生物样品中RNA的表达情况及定量的方法，可以用来研究分析细胞转录组在不同组织样品间基因表达差异情况、在时间轴上不同时间点连续的变化，以及转录本的可变剪切和SNP位点等。除了mRNA转录本信息，RNA-Seq技术可以用来研究不同类群的RNA，包括miRNA，tRNA，rRNA，lncRNA等。
WGS (whole genome sequencing,全基因组测序):是指对基因组整体进行高通量测序，分析不同个体间的差异，同时完成SNP及基因组结构注释。可以准确检测出每个样本基因组中的变异集合，也就是人与人之间存在差异的那些DNA序列；全基因组测序由于结果包含完整丰富的信息，可以得到外显子测序或靶向测序不能得到的更多信息，具有其独特的优势。且随着近年来测序技术的不断进步、测序成本的不断降低，使得全基因组测序变得触手可及。而且全基因组测序在鉴定单核苷酸变异（SNP）、插入和缺失突变（Indel）时更有优势，所以WGS逐渐成为了临床和基础研究的另一种选择。
全外显⼦组测序（Whole Exome Sequencing，WES）是指利⽤探针捕获技术将全基因组外显⼦区域DNA捕获并富集后进⾏⾼通量测序的基因组分析⽅法。由于外显⼦测序只需针对外显⼦区域的DNA即可（例如：⼈类外显⼦组只占⼈类基因组⻓度的约1%，但是⽬前由DNA变异引起的疾病估计有85%以上来⾃于外显⼦组区域的变异），因此远⽐进⾏全基因组序列测序更简便、经济、⾼效，其⽬标区域覆盖度也更⾼，便于变异检测。
细胞测序技术（scRNA-seq）作为研究细胞异质性的主流工具，近几年在神经科学、发育生物学和肿瘤免疫等方面的研究中起到了巨大的推动作用，以前.所未有的精度揭示了更丰富的生物学机理。伴随着类器官技术的成熟，单细胞测序技术与类器官的结合也孕育了更多的研究机会，将极大地释放类器官的应用价值。
在过去的几个世纪里，肿瘤的概念已经从一个异常增殖细胞的简单聚集演变成一个高度组织的“器官”。构成肿瘤的各种成分被称为肿瘤微环境，在肿瘤发生发展过程中，包括但不限于巨噬细胞、DC、中性粒细胞、B细胞、T细胞、CAF等多种细胞被招募到肿瘤细胞周围的微环境中，与ECM等元素共同构成TIME。
近年来，免疫检查点抑制剂（Immune Checkpoint Inhibitors, ICIs）在癌症治疗领域取得了显著突破。这些药物通过解除肿瘤微环境中的免疫抑制机制，激活患者自身的免疫系统来攻击癌细胞。然而，尽管ICIs在多种癌症类型中显示了显著疗效，但仍有相当一部分患者对单一药物治疗无响应或产生耐药性。因此，研究人员开始探索ICI与其他疗法的联合使用，以期提高治疗效果并扩大受益人群。
细胞免疫荧光（Immunofluorescence, IF）是一种常用的技术，用于检测细胞内特定蛋白质或其他分子的分布和表达情况。分析细胞免疫荧光的结果涉及多个步骤，包括图像采集、图像处理、定量分析和数据解释。
免疫细胞浸润（Immune Cell Infiltration）是指免疫系统中的各类细胞，如T细胞、B细胞、巨噬细胞以及NK细胞等，迁徙至特定的组织或器官中，以执行相应的免疫功能。这一过程不仅出现在生理状态下，例如在正常免疫监控、炎症反应及移植排斥中，也可见于病理条件下，如肿瘤微环境的调控。
