Perls普鲁士蓝反应(Prussian blue reaction)又称为含铁血黄素染色，即经过亚铁青化钾和稀酸处理后可以产生蓝色，常见于吞噬细胞内或间质内，主要显示三价铁盐。其染色原理为：三价铁离子被从蛋白质中被稀盐酸分离出来，生成不溶解的蓝色化合物，即普鲁士蓝。
劳克坚牢蓝(LFB)属于铜－酞箐染料，在酒精溶液中具有与髓鞘磷脂结合的染色特性。应用LFB髓鞘染色可以很好地显示出神经组织的髓鞘结构。
阿利新蓝（Alcian）又称爱先蓝或阿尔辛蓝等，是一种类铜钛花青共轭染料，该染料分子中带正电荷的盐键和酸性黏液物质中带负电荷的酸性基团结合呈蓝色。常用于软骨组织或早幼粒细胞、巨核细胞染色。
油红O脂肪染色法是指在日常病理诊断和科研工作中为了显示组织内的脂肪常采用油红O进行染色的方法，油红O为脂溶性染料，在脂肪内能高度溶解，可特异性的使组织内甘油三酯等中性脂肪着色。
天狼猩红是强酸性染料，易与胶原分子中的碱性基团结合，提高分辨率，从而区分两型胶原纤维。其溶剂为衬染PA饱和溶液，主要用于各种组织病变时，对胶原纤维异常或纤维增生的组织纤维染成红色。
免疫组化(IHC) 是应用免疫学基本原理——抗原抗体反应，即抗原与抗体特异性结合的原理，通过化学反应使标记抗体的显色剂 (荧光素、酶、金属离子、同位素) 显色来确定组织细胞内抗原(多肽蛋白质)，对其进行定位、定性及定量的研究，称为免疫组织化学技术(immunohistochemistry，IHC)或免疫细胞化学技术(immunocytochemistry，ICC)。
免疫荧光技术又称为荧光抗体技术，将荧光标记技术和免疫学方法结合起来，利用抗原抗体相互作用从而对组织或细胞内的抗原或抗体物质进行定位、示踪、定性以及相对定量等。
masson染色是指用两种或三种阴离子染料混合，胶原纤维呈蓝色，肌纤维呈红色。用来显示组织中纤维以及炎性因子的染色方法之一。
